เรื่องราวเริ่มขึ้นเมื่อเด็กหนุ่มชื่อ ไทจู กำลังจะสารภาพรักกับ ยูซึริฮะ สาวที่เขาชอบ แต่เกิดเหตุมนุษยชาติถูกทำให้กลายเป็นหินทั้งหมด เวลาผ่านไปกว่าสามพันปี ในปี 5738 ไทจู ได้หลุดออกมาจากหิน และได้พบกับเพื่อนเก่าเขา เซ็นคุ ที่หลุดออกมาก่อน ทั้งสองร่วมกันใช้ความรู้และวิทยาการทางวิทยาศาสตร์ในอดีต เพื่อสร้างอารยธรรมมนุษย์ขึ้นมาใหม่

แหล่งที่มาDr.Stone